30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0690 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0690  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3578  LuxR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4624  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4008  LuxR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3799  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4329  LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4197  response regulator receiver protein  42.08 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0526  hypothetical protein  27.84 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2142  hypothetical protein  28.23 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.532898  normal  0.0656443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0755  hypothetical protein  24.51 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.684175  hitchhiker  0.00000180736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1731  hypothetical protein  26.8 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2457  hypothetical protein  29.08 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.418113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2144  hypothetical protein  25.42 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.389277  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  27.74 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1969  hypothetical protein  29.41 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2091  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0353766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3996  hypothetical protein  34.67 
 
 		 185 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  45.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  36.23 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 96 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 96 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  29.63 
 
 		 887 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 77 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>