266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9055 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  66.22 
 
 
376 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  61.34 
 
 
224 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  61.45 
 
 
172 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  38.67 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  38.06 
 
 
250 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  42.29 
 
 
197 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  27.75 
 
 
362 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  29.71 
 
 
362 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  27.75 
 
 
362 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.53 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  27.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  27.44 
 
 
363 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  27.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  27.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  27.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  27.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.44 
 
 
363 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  25.94 
 
 
355 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  27.44 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  27.44 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  27.44 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.08 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  26.76 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  26.76 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  26.76 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  24.29 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2666  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  27.41 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  43.55 
 
 
176 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.04 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  22.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2928  hypothetical protein  22.16 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  26.91 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  26.91 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  26.91 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  28.79 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  27.17 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  21.84 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  26.57 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  24.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  24.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  24.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  26.41 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  27.3 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  26.41 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  26.21 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  26.21 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  26.41 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  26.41 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  26.41 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  27.22 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  25.55 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  25.55 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.59 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  26.2 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  25.62 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  25.48 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  28.43 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  25.63 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  25.63 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  25.63 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  26.04 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  25.85 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  27.98 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>