18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8783 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  47.22 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  46.26 
 
 		 471 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  42 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  38.85 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  44.26 
 
 		 493 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  40.38 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  41.2 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  41.54 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  40.32 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  40.24 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  32.26 
 
 		 827 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.1 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 749 aa  146  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  32.27 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  29.27 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  29.92 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  24.76 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>