41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6920 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  36.61 
 
 
504 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  30.18 
 
 
684 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  29.43 
 
 
689 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  34.85 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  28.35 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  29.46 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  21.58 
 
 
632 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  27.75 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  29.46 
 
 
442 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  22.9 
 
 
477 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  31.55 
 
 
538 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  26.36 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  31.55 
 
 
538 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  23.39 
 
 
482 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  24.06 
 
 
479 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.09 
 
 
532 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.11 
 
 
476 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  28.01 
 
 
511 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  28.01 
 
 
480 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  27.5 
 
 
518 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  21.71 
 
 
613 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.27 
 
 
511 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2815  hypothetical protein  22.95 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  32.43 
 
 
480 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  21.71 
 
 
519 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  25.97 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  25.53 
 
 
497 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  25.62 
 
 
328 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  23.5 
 
 
435 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  23.53 
 
 
484 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.19 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.85 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.56 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  21.9 
 
 
481 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  29.03 
 
 
541 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  19.88 
 
 
537 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  28.8 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  21.97 
 
 
541 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>