18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  71.84 
 
 		 486 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  100 
 
 		 460 aa  944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  61.84 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  63.68 
 
 		 480 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  63.91 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  56.9 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  59.15 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  55.12 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  57.41 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  45.6 
 
 		 636 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  21.19 
 
 		 459 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  27.33 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.38 
 
 		 911 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  23.12 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  23.04 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.88 
 
 		 2096 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.58 
 
 		 913 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  27.27 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>