32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2463 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  80.45 
 
 
206 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  75.39 
 
 
218 aa  277  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  76.76 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  73.3 
 
 
218 aa  270  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  54.82 
 
 
197 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  54.31 
 
 
197 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  53.81 
 
 
197 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  59.04 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  43.62 
 
 
169 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  39.39 
 
 
170 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  34.68 
 
 
175 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  37.7 
 
 
171 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  43.62 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  34.58 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  34.58 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  38.1 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  32.3 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  29.8 
 
 
155 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  33.65 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  26.62 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  37.38 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  28.66 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  31.93 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  27.89 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  26.53 
 
 
164 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  33.56 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>