29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1984 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 391 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  46.26 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  41.7 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  41.74 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  42.48 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  42.79 
 
 		 300 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  42.92 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  41.01 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  42.92 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  34.01 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  39.91 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  42.73 
 
 		 339 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  41.74 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  34.93 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  34.93 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  43.7 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  42.51 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  40 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  42.92 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40.8 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  38.63 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  26.9 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  27.59 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  30.41 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.64 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  27.64 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  27.27 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  28.02 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  28.7 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>