56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4947 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  37.14 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  37.14 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  39.23 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  34.58 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  34.43 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  29.09 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  27.4 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  27.22 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.48 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.48 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.06 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  25.62 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  28.04 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.03 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.45 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  32.26 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  30.66 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  30.53 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.93 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.93 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  23.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  29.71 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  28.03 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.54 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.83 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.2 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  23.2 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  22.8 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 		 232 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  24.1 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.96 
 
 		 220 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.62 
 
 		 296 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.96 
 
 		 220 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  32.82 
 
 		 222 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.32 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 		 214 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>