More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2678 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 142 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  89.47 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  89.47 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  89.47 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  85.29 
 
 		 140 aa  242  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  84.56 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  86.92 
 
 		 135 aa  239  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  78.68 
 
 		 139 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  77.69 
 
 		 132 aa  216  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  77.69 
 
 		 132 aa  216  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  76.92 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  81.3 
 
 		 130 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  81.3 
 
 		 130 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  81.3 
 
 		 130 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  81.3 
 
 		 130 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  81.15 
 
 		 130 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  72.73 
 
 		 154 aa  193  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  59.84 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  59.69 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  59.35 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  57.36 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  56.1 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  54.03 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  55.28 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  54.24 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  51.97 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  51.24 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  45.04 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  47.2 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  46.72 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  43.85 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48610  Thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  43.9 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  50 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  42.31 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  43.55 
 
 		 228 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  42.31 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  44.8 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>