More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0708 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 570 aa  1162    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 		 558 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  48.88 
 
 		 552 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  47.44 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  45.62 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 		 554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 		 552 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  48.17 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  47.8 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 550 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  45.21 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  46.24 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  45.45 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  44.44 
 
 		 550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  44.75 
 
 		 556 aa  452  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  46.52 
 
 		 554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  45.15 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  44.52 
 
 		 556 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  45.32 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  44.83 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  45.44 
 
 		 550 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  45.22 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  44.86 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  44.18 
 
 		 558 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  43.3 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  42.34 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  42.52 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  44.98 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  44.59 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  42.52 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  45.09 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  42.44 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  47.07 
 
 		 556 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  46.1 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  44.04 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  43.45 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  46.2 
 
 		 553 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  44.2 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  43.12 
 
 		 557 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  43.88 
 
 		 565 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  44.61 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  42.62 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  42.83 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  43.43 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  42.44 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  43.43 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  45.01 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  42.6 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  41.67 
 
 		 555 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1850  Dihydroxy-acid dehydratase  39.34 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0203802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  42.91 
 
 		 560 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  44.31 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  42 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  41.82 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 		 557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  42 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 558 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  44.9 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  42 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  42 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  41.82 
 
 		 557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  42.15 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1970  Dihydroxy-acid dehydratase  44.79 
 
 		 556 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2747  dihydroxy-acid dehydratase  44.1 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  44.1 
 
 		 553 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  41.92 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  42.49 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  44.34 
 
 		 579 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  43.19 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  44.3 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  42.21 
 
 		 562 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  40.44 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  40.14 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  41.3 
 
 		 573 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  41.85 
 
 		 567 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  41.81 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  42.19 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  41.49 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  41.35 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  42.34 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  41.62 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  41.49 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  40.26 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  41.62 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  41.48 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  42.19 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>