29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2828 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2827  BRCT domain-containing protein  78.43 
 
 		 796 aa  970    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  38.89 
 
 		 1263 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  34.48 
 
 		 1749 aa  62  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  46.05 
 
 		 1015 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.98 
 
 		 1107 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.98 
 
 		 472 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.04 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.38 
 
 		 508 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.47 
 
 		 482 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.74 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.78 
 
 		 886 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.33 
 
 		 476 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2596  leucine-rich repeat-containing protein  32.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  38.2 
 
 		 528 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30 
 
 		 467 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.94 
 
 		 867 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.83 
 
 		 354 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  36.47 
 
 		 249 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  31.33 
 
 		 204 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.69 
 
 		 448 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.8 
 
 		 1344 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  29.21 
 
 		 528 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  35.29 
 
 		 291 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.55 
 
 		 713 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.71 
 
 		 761 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  37.7 
 
 		 293 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  35.37 
 
 		 127 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>