45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2790 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  80.92 
 
 		 131 aa  215  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  74.6 
 
 		 129 aa  205  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  78.99 
 
 		 134 aa  197  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  76 
 
 		 132 aa  197  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  74.8 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  74.8 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  74.8 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  74.8 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  78.15 
 
 		 134 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  78.15 
 
 		 134 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  73.23 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  70.4 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  67.5 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  61.48 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  62.16 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  28 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.17 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  29.91 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  30.85 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  35.92 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  28.04 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  25.78 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  26.76 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  24.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  28.97 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  26.39 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  28.97 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  24.53 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  25.83 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  28.04 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  27.36 
 
 		 161 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>