27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6285 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  753    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  42.56 
 
 		 399 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  38.46 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  35.98 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  34.73 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  34.31 
 
 		 445 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  39.22 
 
 		 257 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  39.13 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  26.24 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  27.68 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  25.24 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  21.88 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  24.55 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  27.03 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.17 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  25.07 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 465 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  25.56 
 
 		 410 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  25.94 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  25.94 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  25.94 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  27.13 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  23.5 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  23.37 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  34.92 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>