35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5694 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  55.34 
 
 
215 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  54.85 
 
 
215 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  46.63 
 
 
210 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  47.17 
 
 
224 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  45.24 
 
 
210 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.89 
 
 
224 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.42 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  34.76 
 
 
219 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  33.02 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.86 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.26 
 
 
330 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.35 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.67 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 
227 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.73 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.85 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  25.99 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.99 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.3 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.73 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.51 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  25.88 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.58 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.09 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  26.54 
 
 
227 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
212 aa  42  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  20.38 
 
 
213 aa  42  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  26.95 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 
238 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>