51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4369 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  56.29 
 
 
306 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  49.35 
 
 
303 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  47.81 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  42.19 
 
 
316 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  32.58 
 
 
325 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  22.98 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  29.13 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  24.28 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  20.27 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  19.93 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  27.27 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  19.8 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.63 
 
 
304 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  25.83 
 
 
304 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.43 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.29 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.19 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.87 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  20 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  28.48 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  25.33 
 
 
294 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  32.22 
 
 
310 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  28.45 
 
 
331 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  32.22 
 
 
315 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0259  PfkB domain protein  27.21 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.48 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  32.26 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  32.26 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  24.24 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  51.22 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  61.11 
 
 
645 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  19.87 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  24.39 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.06 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  25.87 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  61.29 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  61.29 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  23.65 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  22.55 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  25.61 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  31.11 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  26.54 
 
 
332 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>