22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2408 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2408  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  304  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  50.94 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  49.69 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  38.01 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  39.22 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  38.82 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 327 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  30.6 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  31.55 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  35.58 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  33.55 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  35.21 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  32.28 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 347 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>