More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4907 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  100 
 
 		 348 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  48.56 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0606  glutathione synthetase  48.54 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000326698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  48.25 
 
 		 348 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  45.98 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  34.64 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  33.63 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1597  glutathione synthetase  31.96 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.890547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  31.73 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  32.37 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  34.39 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  31.83 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  35.13 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  34.81 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  32.37 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  34.21 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  32.14 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  33.75 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  35.35 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  34.78 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  33.88 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  34.07 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  33.23 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  33.64 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  33.02 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  34.07 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  32.91 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  36.4 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  32.05 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  36.8 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  33.13 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  29.45 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  34.57 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  33.13 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  29.45 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3221  glutathione synthetase  29.38 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2899  glutathione synthetase  30.92 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000207563  normal  0.923755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  33.43 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  32.93 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  33.12 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0914  glutathione synthetase  28.99 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0474988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  34.18 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  30.74 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  34.92 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  33.12 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  32.38 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  30.94 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  31.19 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  30.55 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  33.85 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  31.09 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  32.49 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  31.51 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  31.41 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  32.33 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  32.13 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  33.65 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  33.02 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  32.7 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  31.75 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  33.03 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  32.24 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  33.54 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  34.78 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  31.83 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  31.27 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  29.94 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  29.82 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  31.19 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  30.67 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  31.69 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  30.86 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  30.67 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  31.11 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  30.16 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  31.85 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  36.25 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  34.8 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  34.8 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  34.8 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  31.85 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  28.88 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  29.14 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  31.33 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  34 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  31.33 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  33.6 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  31.27 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  31.85 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  34 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  30.77 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  31.53 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  32.34 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  31.08 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  31.53 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>