49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3792 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  100 
 
 		 334 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  58.21 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  59.21 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  61.59 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  57.96 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  60.26 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  58.84 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  61.79 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.73 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  57.1 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  55.02 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  58.47 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  50.76 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  57.67 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  50.76 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  55.67 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  54.72 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  51.51 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.55 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.87 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.22 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  48.8 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  51.33 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  51.88 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  49.49 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  50.34 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  46.69 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  47.49 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  43.85 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  43.51 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  40.32 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.97 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.97 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  38.92 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.65 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.61 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  39.74 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  38.41 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  33 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  31.86 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.41 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.14 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  31.25 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  31.25 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  31.25 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  31.25 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  31.25 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  31.25 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>