251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2469 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2469  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.271391  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  37.86 
 
 
241 aa  141  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  42.86 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  35.71 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  35.98 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  41.55 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  36.57 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  36.65 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  34.53 
 
 
241 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  39.73 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  47.4 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  36.02 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  37.21 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  40.85 
 
 
233 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  34.76 
 
 
219 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  37.62 
 
 
222 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  35.68 
 
 
223 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  38.1 
 
 
222 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  31.07 
 
 
221 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  48.8 
 
 
248 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  38.14 
 
 
223 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  37.62 
 
 
317 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  33.18 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4667  deoxyribose-phosphate aldolase  40.67 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  0.995348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  38.28 
 
 
409 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  39.32 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  32.08 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  33.8 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  35.55 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  36.82 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
231 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  36.19 
 
 
213 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  36.86 
 
 
269 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  34.88 
 
 
224 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  36.2 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  39.17 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  44.67 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  37.26 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  34.62 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  34.42 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  33.5 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 
223 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  36.36 
 
 
256 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  36.49 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  37.67 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  36.32 
 
 
220 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  34.84 
 
 
227 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 
223 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  34.98 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  37.21 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  33.17 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  35.38 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  35.71 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  33.49 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  36.19 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  36.65 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  31.96 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  31.31 
 
 
222 aa  113  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  37.04 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  32.37 
 
 
222 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  38.12 
 
 
236 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  35.58 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  35.58 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  38.14 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  35.35 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  39.74 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  36.19 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  39.17 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  41.29 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  36.53 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  37.26 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  41.29 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  37.26 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  34.38 
 
 
215 aa  109  3e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  36.62 
 
 
223 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  31.31 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  40.38 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  36.97 
 
 
223 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  36.97 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  36.97 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  36.97 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  34.58 
 
 
224 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  33.97 
 
 
217 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  42.65 
 
 
235 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.574105  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  35.87 
 
 
229 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  33.02 
 
 
220 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  40.65 
 
 
231 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  35.37 
 
 
212 aa  105  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  33.49 
 
 
218 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  34.25 
 
 
247 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  35.71 
 
 
219 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  33.02 
 
 
219 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  33.5 
 
 
220 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  40.13 
 
 
224 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>