37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1709 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  40.6 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  36.09 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  39.1 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  30.34 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  35.34 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  35.34 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  29.79 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  35.38 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  35.16 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  28.9 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  27.74 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  28.17 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  26.43 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  44.3 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  31.63 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  48.15 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  43.48 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  43.48 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  40.28 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  40.28 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  46.3 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  45.76 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  46.55 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  45.28 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>