29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6095 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  264  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  63.48 
 
 
120 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  57.38 
 
 
122 aa  147  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  62.04 
 
 
113 aa  147  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  52.38 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  58.33 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  55.17 
 
 
120 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  58.18 
 
 
126 aa  139  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  53.51 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  53.15 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  54.7 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  51.4 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  44.53 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  46.09 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  43.12 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  46 
 
 
129 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  43.24 
 
 
124 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  84.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  38.53 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  33.05 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  30.49 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  34.67 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  40.62 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  30.56 
 
 
206 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  37.88 
 
 
202 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>