19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4333 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 758 aa  1540    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4531  FG-GAP repeat protein  36.72 
 
 		 788 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.29 
 
 		 8871 aa  88.2  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  24.11 
 
 		 758 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  26.71 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  24.79 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  26.03 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.27 
 
 		 2000 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  27.47 
 
 		 503 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.65 
 
 		 1838 aa  52.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  23.29 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  23.03 
 
 		 1337 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1638 aa  48.5  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  36.27 
 
 		 730 aa  48.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.74 
 
 		 433 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.61 
 
 		 1527 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.14 
 
 		 1019 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1328 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.83 
 
 		 1129 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>