More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3836 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
325 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
323 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.19 
 
 
321 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
315 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  41.52 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  40.13 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
321 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
320 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.63 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.17 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.02 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.02 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.17 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.02 
 
 
666 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.17 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
302 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.85 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
322 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  40.6 
 
 
281 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
319 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.72 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0050  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29 
 
 
325 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.8 
 
 
318 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
320 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  29.61 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.61 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.61 
 
 
328 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.33 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.62 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.33 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.41 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  28.38 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  28.38 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  29.28 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  28.62 
 
 
328 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.37 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.41 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  29.97 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.87 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
328 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  29.66 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  27.81 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.81 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.2 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.37 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  27.81 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.69 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.69 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.03 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.69 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.1 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1697  hypothetical protein  26.33 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.73 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  29.33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.69 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1696  hypothetical protein  26 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.94 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.87 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.38 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.07 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  29.33 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.32 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.33 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.38 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0170  cyclic nucleotide-binding protein  28.76 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.836183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.92 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.52 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.79 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.15 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  27.31 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.97 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.05 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.44 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>