More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0170 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0170  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
345 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.836183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0397  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.11 
 
 
327 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  54.57 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3176  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  64.39 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0533884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.94 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.8 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.23 
 
 
327 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  51.38 
 
 
324 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.07 
 
 
326 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  51.64 
 
 
353 aa  292  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.62 
 
 
334 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.37 
 
 
332 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.04 
 
 
338 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  47.55 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 
327 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.23 
 
 
331 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.77 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.62 
 
 
320 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.04 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  51.84 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  46.93 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.75 
 
 
326 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.75 
 
 
334 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.65 
 
 
335 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 
334 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01790  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.63 
 
 
332 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.46 
 
 
333 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.76 
 
 
325 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.17 
 
 
341 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  50.49 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.69 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  53.5 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
333 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.99 
 
 
329 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.49 
 
 
328 aa  272  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.35 
 
 
332 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  44.37 
 
 
336 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.65 
 
 
333 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.37 
 
 
336 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  44.37 
 
 
336 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  52.45 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.15 
 
 
342 aa  269  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
328 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.51 
 
 
334 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 
332 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  53.19 
 
 
325 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
353 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  47.68 
 
 
328 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  43.85 
 
 
332 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  44 
 
 
335 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
335 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.19 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
325 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.89 
 
 
336 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
332 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
332 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.24 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  47.91 
 
 
345 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.91 
 
 
345 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
333 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.56 
 
 
320 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.35 
 
 
338 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.59 
 
 
356 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  51.38 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.67 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03640  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.4 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.04 
 
 
336 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  45.56 
 
 
338 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
334 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.79 
 
 
338 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  48.68 
 
 
325 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.57 
 
 
339 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
339 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.41 
 
 
317 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.43 
 
 
336 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.3 
 
 
332 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.77 
 
 
334 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
327 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.59 
 
 
323 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.72 
 
 
332 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
340 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
344 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.87 
 
 
339 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 
339 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 
339 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.28 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.59 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.59 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.59 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.59 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.59 
 
 
339 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.59 
 
 
360 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>