224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3532 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  100 
 
 
410 aa  821    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  35.05 
 
 
351 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0487  acyltransferase 3  30.51 
 
 
400 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25.53 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.9 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  32.8 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  30.28 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  38.82 
 
 
671 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  33.48 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  35.4 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  39.87 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.72 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  36.65 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.03 
 
 
616 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  34.56 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.8 
 
 
656 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  26.2 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.02 
 
 
660 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  27.95 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  36.02 
 
 
656 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  36.63 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  29.12 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  30.28 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  30 
 
 
603 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  30 
 
 
603 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  35.5 
 
 
645 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  32.72 
 
 
607 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  22 
 
 
367 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  33.51 
 
 
671 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.22 
 
 
695 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.25 
 
 
656 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  30.89 
 
 
977 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  24 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  28.03 
 
 
682 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  32.5 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  34.69 
 
 
625 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  33.9 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  30.73 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  33.91 
 
 
658 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.41 
 
 
665 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  33.91 
 
 
658 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3854  putative acyltransferase  26.4 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.79 
 
 
660 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.29 
 
 
690 aa  59.7  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  30.6 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  31.55 
 
 
657 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  36.67 
 
 
716 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  26.37 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  32.74 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.08 
 
 
629 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  30.17 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  33.54 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1900  hypothetical protein  29.79 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.41 
 
 
681 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  35.71 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.64 
 
 
642 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.34 
 
 
695 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.44 
 
 
629 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1721  acyltransferase  29.79 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1744  acyltransferase  29.79 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.15 
 
 
673 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  29.95 
 
 
657 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  31.01 
 
 
604 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  27.62 
 
 
634 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  25.89 
 
 
621 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  31.01 
 
 
604 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  30.77 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  37.13 
 
 
679 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  31.9 
 
 
683 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  29.35 
 
 
622 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  35.58 
 
 
654 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  25.47 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.81 
 
 
660 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  26.96 
 
 
647 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0715  hypothetical protein  30.89 
 
 
394 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.48 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.36 
 
 
635 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  31.21 
 
 
643 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.22 
 
 
759 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.21 
 
 
667 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  33.72 
 
 
710 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  35.93 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  34.19 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.2 
 
 
662 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  33.72 
 
 
710 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  26.09 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.76 
 
 
635 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  33.94 
 
 
684 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  28.42 
 
 
696 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  26.44 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  33.13 
 
 
646 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  24.42 
 
 
690 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  29.7 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  31.25 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  31.51 
 
 
592 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.17 
 
 
690 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  25.06 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  24.8 
 
 
637 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.13 
 
 
777 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>