15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3498 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 1440 aa  2909    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1414 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1439 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1079 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  30.86 
 
 		 349 aa  155  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  31.71 
 
 		 2278 aa  141  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  26.39 
 
 		 659 aa  138  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1386 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 774 aa  84.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  31.53 
 
 		 1750 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  31.03 
 
 		 691 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  38.37 
 
 		 792 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  36.25 
 
 		 915 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  43.04 
 
 		 990 aa  48.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>