30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0428 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 678 aa  1409    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  32.02 
 
 		 672 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  31.47 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 		 656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  29.18 
 
 		 673 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  26.83 
 
 		 677 aa  273  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  26.25 
 
 		 667 aa  254  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  24.74 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  21.04 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  19.83 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  19.35 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.19 
 
 		 1257 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  24.53 
 
 		 1256 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  20.77 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 		 1256 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  20.16 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1433 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 		 1431 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1433 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 1256 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.45 
 
 		 1225 aa  54.3  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 672 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  23.81 
 
 		 672 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1253 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  19.81 
 
 		 635 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  25.57 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  21.48 
 
 		 659 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  23.08 
 
 		 647 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  23.08 
 
 		 647 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1028 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>