More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37090  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  100 
 
 
96 aa  184  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.9 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  46.91 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.316901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1800  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502028  normal  0.0883001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  42.86 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.15 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2447  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.37 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.121306  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.59 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.59 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.31 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1271  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  44.19 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.472876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.25 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.27 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.51 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.51 
 
 
94 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  37.04 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.51 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.51 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.53 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.75 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.27 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  39.74 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.19 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.27 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.37 
 
 
171 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  36.59 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  35.37 
 
 
171 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.15 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.14 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.73 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.97 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.9 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.52 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.46 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5120  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.65 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.27 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5598  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.18 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2319  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.02 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4327  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.02 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  0.0303459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29540  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.497056  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1122  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.14 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.59 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.8 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  34.15 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.8 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.19 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.55 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  36.59 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.44 
 
 
150 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1773  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.42 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1256  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.35 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.14 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19120  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  43.42 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.84 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.15 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2423  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  36.84 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.72522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.14 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>