More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  100 
 
 		 422 aa  837    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  61.28 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  61.03 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  46 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  45.79 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  47.28 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  44.01 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  41.27 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.92 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.94 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.6 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.15 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.07 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.48 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.7 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.07 
 
 		 398 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.09 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.82 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.42 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.36 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.63 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.89 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.47 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  37.66 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.94 
 
 		 377 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.64 
 
 		 383 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.41 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.3 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.94 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.72 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.78 
 
 		 383 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.28 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.22 
 
 		 376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.8 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.3 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 		 379 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.57 
 
 		 353 aa  196  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.06 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.95 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.07 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.65 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.2 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.18 
 
 		 382 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.08 
 
 		 360 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.26 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.14 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.55 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.32 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.31 
 
 		 376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.83 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  39.44 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.86 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  39.44 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.83 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 		 354 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.91 
 
 		 350 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.46 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.29 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.46 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.54 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  35.49 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.58 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.6 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.06 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.78 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.45 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.65 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.68 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.54 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.57 
 
 		 359 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 		 378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.42 
 
 		 392 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.68 
 
 		 378 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>