52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  47.49 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  52.91 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  50.24 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  39.07 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  48.54 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  34.81 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  31.56 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  31.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.59 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  29.08 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  31.29 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  37.25 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0583  hypothetical protein  28.22 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  32.63 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  28.24 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  27.88 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  29.31 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  27.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  28.25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  28.81 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  30.37 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3265  YceI family protein  27.64 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  30.87 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  29.31 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  30.71 
 
 		 534 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  32.04 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  32.04 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  32.04 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  34.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  29.46 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  31.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  25.84 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  26.72 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  29.83 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  31.11 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.85 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.26 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.43 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.97 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  28.48 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  35.77 
 
 		 182 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>