More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
319 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.68 
 
 
300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.93 
 
 
307 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.49 
 
 
301 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.43 
 
 
304 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  50.64 
 
 
304 aa  296  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.05 
 
 
284 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 
297 aa  268  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
277 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.76 
 
 
296 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  48.11 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.44 
 
 
299 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
299 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  45.1 
 
 
315 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
303 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
284 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
276 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
271 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
311 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
274 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.76 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  40.73 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
301 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.47 
 
 
278 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
279 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
270 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
279 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
310 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
278 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  34.56 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.64 
 
 
295 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.73 
 
 
272 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00114182  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
277 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
297 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
295 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
275 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
278 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
273 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.21 
 
 
273 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  35.23 
 
 
274 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.21 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.21 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
299 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
301 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.21 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.21 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
272 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  38.06 
 
 
272 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  38.22 
 
 
699 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
273 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  33.81 
 
 
295 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
281 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
303 aa  169  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
295 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
285 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 
302 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.51 
 
 
279 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  36.08 
 
 
276 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
290 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
297 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
280 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
268 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.3 
 
 
281 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.3 
 
 
281 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3552  hypothetical protein  37.15 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  28.57 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
280 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
276 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  37.3 
 
 
281 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
301 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
297 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.09 
 
 
281 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
275 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  32.96 
 
 
277 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.96 
 
 
282 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
274 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.48 
 
 
281 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.72 
 
 
281 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>