More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  61.94 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  63.03 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  63.1 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  64.16 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  61.03 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  61.46 
 
 		 294 aa  367  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  60.76 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3218  aldo/keto reductase  61.56 
 
 		 295 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  58.76 
 
 		 295 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  56.58 
 
 		 298 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  48.92 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  48.93 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  46.93 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  46.39 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  46.57 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  47.12 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  45.68 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  46.57 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  46.91 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  48.12 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  45.23 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  45.16 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  45.16 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  45.68 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  47.58 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  46.21 
 
 		 280 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  47.14 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  46.3 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  46.01 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  45.93 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  43.45 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  43.68 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  44.29 
 
 		 282 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  44.29 
 
 		 282 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.13 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  43.57 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  44.73 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.13 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.13 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.13 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  44.44 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  43.57 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.4 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  45.88 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 275 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  44.4 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.3 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.82 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  44.24 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  43.43 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.43 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.62 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  45.49 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  43.68 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.73 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  42.86 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  45.56 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.07 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.07 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.59 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.37 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.37 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  42.23 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.81 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  48.69 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  44.44 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1687  2,5-didehydrogluconate reductase  46.79 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  44.09 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.43 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  43.17 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  42.76 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  40.36 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  43.68 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  42.86 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.07 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.07 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.07 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.07 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.07 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  41.07 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.07 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  42.36 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  40.36 
 
 		 277 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  46.42 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  47.74 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>