83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  58.73 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  51.18 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  43.1 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  43.1 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  42.74 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  46.6 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  40.74 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  44.66 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  45.63 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  41.35 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  40.95 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  39.58 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  41.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  37.63 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  38 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  39.64 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  38.24 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  37.17 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  38.05 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  41.84 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  31.53 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  45.56 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  28.38 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  36.54 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  32.38 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  34.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  34.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  34.04 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  36.05 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  34.04 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  34.38 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  30.91 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0377  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  27.42 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2779  protein of unknown function DUF419  26.09 
 
 		 123 aa  43.9  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  30.95 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  29 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  29 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  35.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>