23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  56.44 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  43.78 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  48.36 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  47.53 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3174  putative lipase transmembrane protein  42.8 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725914  normal  0.0262248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  31.06 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.53 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.73 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  26.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.7 
 
 		 338 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.94 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  36.13 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.85 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  29.94 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.01 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  27.27 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  27.48 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  28.76 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.41 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  26.95 
 
 		 334 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.93 
 
 		 342 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>