227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4354 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
575 aa  1195    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.2 
 
 
576 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  28.75 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.45 
 
 
635 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  26.47 
 
 
594 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.7 
 
 
580 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.48 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.19 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.73 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.87 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.87 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.22 
 
 
604 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  28.29 
 
 
269 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.94 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  25.31 
 
 
462 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  27.35 
 
 
589 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.83 
 
 
244 aa  59.7  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.29 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02327  Adenylyltransferase and sulfurtransferase uba4 (Ubiquitin-like protein activator 4)(Common component for nitrate reductase and xanthine dehydrogenase protein F) [Includes Adenylyltransferase uba4(EC 2.7.7.-);Sulfurtransferase uba4(EC 2.8.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59954]  30.97 
 
 
560 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.681614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.5 
 
 
358 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.76 
 
 
771 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
244 aa  57.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  42.67 
 
 
257 aa  57.4  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 
248 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.76 
 
 
291 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.42 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  26.9 
 
 
550 aa  57  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
592 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  57  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.8 
 
 
203 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.7 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.76 
 
 
553 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.04 
 
 
259 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.25 
 
 
252 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.82 
 
 
249 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.34 
 
 
268 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.14 
 
 
215 aa  55.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.08 
 
 
380 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  33.96 
 
 
340 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  25.66 
 
 
236 aa  54.7  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.28 
 
 
201 aa  53.9  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.33 
 
 
379 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.74 
 
 
407 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  27.85 
 
 
250 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.97 
 
 
242 aa  53.5  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  32.69 
 
 
249 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.67 
 
 
255 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.69 
 
 
249 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.67 
 
 
255 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.02 
 
 
264 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.67 
 
 
255 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.67 
 
 
255 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  31.54 
 
 
235 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.95 
 
 
273 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  26.32 
 
 
428 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.93 
 
 
253 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.95 
 
 
207 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.28 
 
 
261 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.63 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.87 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.25 
 
 
255 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.66 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.8 
 
 
355 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  24.72 
 
 
338 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0912  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.65 
 
 
242 aa  52  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  38.03 
 
 
253 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.63 
 
 
267 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44749  sumo-activating enzyme 2  41.54 
 
 
643 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.97194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
278 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.54 
 
 
245 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.16 
 
 
383 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.28 
 
 
199 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.3 
 
 
256 aa  50.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.79 
 
 
256 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34373  predicted protein  25.37 
 
 
418 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.7 
 
 
392 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.89 
 
 
255 aa  50.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.23 
 
 
383 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.4 
 
 
272 aa  50.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08540  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.51 
 
 
403 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  31.58 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.5 
 
 
199 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.02 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.92 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.89 
 
 
267 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81395  predicted protein  25.57 
 
 
443 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.91 
 
 
389 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.89 
 
 
202 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.26 
 
 
243 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.83 
 
 
258 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  42.86 
 
 
451 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.55 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.92 
 
 
237 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.09 
 
 
347 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3180  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.56 
 
 
249 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507931  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  30.1 
 
 
252 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.7 
 
 
348 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>