More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1318 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
635 aa  1309    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.86 
 
 
580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  32.76 
 
 
293 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.47 
 
 
259 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.35 
 
 
576 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 
591 aa  100  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.36 
 
 
596 aa  94  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  30.45 
 
 
594 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.45 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  21.36 
 
 
550 aa  73.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4665  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.02 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527607  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.71 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
250 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.33 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.88 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.87 
 
 
249 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 
553 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.29 
 
 
255 aa  64.3  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.12 
 
 
480 aa  63.9  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.43 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  27.18 
 
 
252 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.85 
 
 
252 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.55 
 
 
250 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.55 
 
 
250 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 
243 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.85 
 
 
252 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.11 
 
 
250 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.06 
 
 
274 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 
348 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.88 
 
 
604 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3690  putative ubiquitin-activating enzyme  27.4 
 
 
253 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.09 
 
 
604 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.88 
 
 
604 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.54 
 
 
771 aa  60.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  28.35 
 
 
339 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.29 
 
 
264 aa  60.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  29.1 
 
 
249 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4411  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.19 
 
 
274 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.44 
 
 
271 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  28.35 
 
 
339 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  31.93 
 
 
260 aa  60.1  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  31.3 
 
 
252 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.99 
 
 
252 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  21.88 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.47 
 
 
251 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.89 
 
 
255 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1233  molybdopterin biosynthesis protein  30.06 
 
 
269 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
247 aa  58.9  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 
260 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.58 
 
 
259 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.33 
 
 
278 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.43 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.43 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  30.17 
 
 
260 aa  58.2  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 
256 aa  58.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.54 
 
 
252 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  29.23 
 
 
349 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.65 
 
 
269 aa  57.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.23 
 
 
348 aa  57.4  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  29.94 
 
 
249 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.94 
 
 
249 aa  57.4  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.55 
 
 
379 aa  57.4  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.76 
 
 
261 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  26.15 
 
 
252 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.54 
 
 
371 aa  57.4  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0766  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.48 
 
 
270 aa  57  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0217212  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0649  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.38 
 
 
339 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.71 
 
 
249 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.8 
 
 
273 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
306 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.03 
 
 
364 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  32.58 
 
 
249 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.91 
 
 
356 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
306 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  29.41 
 
 
257 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.27 
 
 
244 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.73 
 
 
386 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.95 
 
 
339 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.08 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.79 
 
 
251 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  26.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.65 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.16 
 
 
246 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.75 
 
 
282 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4091  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 
274 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  28.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
248 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0803  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  24.39 
 
 
339 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 
244 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0887  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.78 
 
 
339 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.79 
 
 
251 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>