More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2344 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  89.85 
 
 
594 aa  1065    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
591 aa  1202    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.29 
 
 
580 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  33.05 
 
 
293 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.85 
 
 
259 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 
635 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.71 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.95 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.29 
 
 
215 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.86 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.15 
 
 
598 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  43 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.6 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.52 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.19 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  38.94 
 
 
300 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
248 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.73 
 
 
396 aa  66.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.05 
 
 
300 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  40.54 
 
 
302 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  30.23 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.86 
 
 
592 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.05 
 
 
300 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  38.02 
 
 
257 aa  64.3  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.29 
 
 
267 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.9 
 
 
456 aa  64.3  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.86 
 
 
268 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.33 
 
 
267 aa  63.9  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  26.34 
 
 
379 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.05 
 
 
393 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.15 
 
 
604 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.33 
 
 
267 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1661  rhodanese-like protein  29.31 
 
 
380 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  34.85 
 
 
260 aa  62.4  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.53 
 
 
264 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  24.62 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.15 
 
 
604 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.74 
 
 
259 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  25.27 
 
 
550 aa  62  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  39.76 
 
 
266 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
382 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.84 
 
 
586 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.94 
 
 
393 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1833  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.33 
 
 
267 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  30.8 
 
 
393 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.57 
 
 
395 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.49 
 
 
390 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  39.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.71 
 
 
364 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.97 
 
 
390 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.39 
 
 
295 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
219 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.59 
 
 
451 aa  61.2  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.26 
 
 
203 aa  60.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.38 
 
 
604 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
303 aa  60.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.8 
 
 
262 aa  60.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.37 
 
 
277 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.11 
 
 
393 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.17 
 
 
285 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  41.25 
 
 
252 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.05 
 
 
246 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.51 
 
 
278 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
244 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 
330 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.14 
 
 
266 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  34.86 
 
 
250 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  41.25 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 
355 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.57 
 
 
390 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  35.63 
 
 
272 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.01 
 
 
348 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.2 
 
 
392 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00144  Thiamine biosynthesis protein ThiF  31.47 
 
 
233 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  40.96 
 
 
285 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.36 
 
 
398 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.03 
 
 
255 aa  58.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.04 
 
 
387 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.96 
 
 
254 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.6 
 
 
259 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.45 
 
 
200 aa  57.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.08 
 
 
207 aa  57.8  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.87 
 
 
285 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38 
 
 
303 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.87 
 
 
285 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  29.91 
 
 
381 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  38.55 
 
 
266 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.29 
 
 
267 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 
771 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>