155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  100 
 
 
550 aa  1136    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.3 
 
 
576 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.86 
 
 
580 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.46 
 
 
596 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  25.99 
 
 
293 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.36 
 
 
635 aa  73.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.9 
 
 
771 aa  67.8  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  28.85 
 
 
594 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4665  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.4 
 
 
542 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527607  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.27 
 
 
591 aa  62  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
275 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.73 
 
 
275 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.66 
 
 
259 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.9 
 
 
575 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1454  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.21 
 
 
846 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.728613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.73 
 
 
277 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.05 
 
 
244 aa  54.3  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
604 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.86 
 
 
355 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.52 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3690  putative ubiquitin-activating enzyme  34.07 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 
244 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  29.46 
 
 
272 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.09 
 
 
263 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  32.67 
 
 
264 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.91 
 
 
263 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  35.92 
 
 
387 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  21.34 
 
 
589 aa  50.8  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.12 
 
 
604 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 
262 aa  50.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.12 
 
 
604 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.25 
 
 
247 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.21 
 
 
200 aa  50.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.64 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  32.67 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  36.25 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.52 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  32.35 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.28 
 
 
255 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.81 
 
 
281 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1916  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  33.62 
 
 
351 aa  49.3  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00387798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.63 
 
 
237 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
598 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  31.71 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
268 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.7 
 
 
203 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  27.34 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  28.33 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.62 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.33 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 
258 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.67 
 
 
270 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5151  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
321 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  28.3 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  31.71 
 
 
275 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.71 
 
 
275 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
300 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.66 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 
260 aa  48.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.17 
 
 
264 aa  47.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  31.07 
 
 
423 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.95 
 
 
386 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
277 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
350 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.05 
 
 
257 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  30 
 
 
390 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
270 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  33.67 
 
 
391 aa  47.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.09 
 
 
266 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0354  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.71 
 
 
317 aa  47.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.93 
 
 
273 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  28.57 
 
 
302 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 
260 aa  47  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.78 
 
 
220 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.44 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.25 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.88 
 
 
263 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  32.04 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.42 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  26.79 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.48 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.82 
 
 
233 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.63 
 
 
239 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  32.04 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  32.97 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.47 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.67 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.78 
 
 
399 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.97 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  29.69 
 
 
390 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.28 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>