239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2212 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
576 aa  1177    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.2 
 
 
575 aa  170  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.79 
 
 
580 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  25.3 
 
 
550 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.35 
 
 
635 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4665  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.51 
 
 
542 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527607  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.23 
 
 
596 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  27.95 
 
 
594 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.95 
 
 
591 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  26.23 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  21.88 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.46 
 
 
553 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.84 
 
 
259 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.12 
 
 
604 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.12 
 
 
604 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.95 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.75 
 
 
598 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.84 
 
 
249 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.29 
 
 
265 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.9 
 
 
387 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.52 
 
 
264 aa  58.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  28.35 
 
 
272 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.38 
 
 
592 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3690  putative ubiquitin-activating enzyme  31.78 
 
 
253 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.68 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.57 
 
 
266 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 
771 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
395 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2074  HesA/MoeB/ThiF family protein  24.39 
 
 
332 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.8 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  32.64 
 
 
387 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.11 
 
 
390 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.04 
 
 
273 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.89 
 
 
220 aa  54.7  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  25.64 
 
 
280 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.95 
 
 
390 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.95 
 
 
377 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.17 
 
 
265 aa  53.9  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  31.11 
 
 
437 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 
390 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.34 
 
 
207 aa  53.9  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.85 
 
 
364 aa  53.9  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  30.16 
 
 
252 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  33.03 
 
 
249 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.03 
 
 
249 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.37 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  29.41 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.92 
 
 
375 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.04 
 
 
586 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.7 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.11 
 
 
386 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  24.86 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.39 
 
 
244 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.27 
 
 
347 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
203 aa  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.22 
 
 
339 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.64 
 
 
392 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.79 
 
 
355 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
258 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.3 
 
 
407 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.21 
 
 
267 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.48 
 
 
248 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.9 
 
 
348 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.9 
 
 
258 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.44 
 
 
339 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  28.72 
 
 
272 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.68 
 
 
282 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.92 
 
 
268 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.83 
 
 
264 aa  50.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 
216 aa  50.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  34.58 
 
 
391 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.81 
 
 
392 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.54 
 
 
236 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.95 
 
 
387 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.58 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  33.6 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.04 
 
 
249 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.5 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.86 
 
 
231 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  28.7 
 
 
252 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.58 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  26.7 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.68 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.58 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  33.6 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.14 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2054  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.83 
 
 
601 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.03 
 
 
267 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.23 
 
 
355 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1642  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.16 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  25.32 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1418  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.75 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.15 
 
 
278 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0887  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  25.61 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  27.94 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.12 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.13 
 
 
250 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  24.68 
 
 
249 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3675  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  25.55 
 
 
338 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>