183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2054 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2054  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
601 aa  1202    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06320  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  51.62 
 
 
554 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.91 
 
 
591 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.91 
 
 
591 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3173  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.4 
 
 
494 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.81 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00852937  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.26 
 
 
604 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.09 
 
 
604 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.42 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.69 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  27.47 
 
 
252 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.47 
 
 
252 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  30.05 
 
 
257 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.8 
 
 
244 aa  61.6  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.84 
 
 
249 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.36 
 
 
207 aa  60.1  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  26.61 
 
 
252 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  27.04 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.45 
 
 
264 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.1 
 
 
213 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  35.04 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.21 
 
 
243 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.72 
 
 
771 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  30.37 
 
 
247 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.29 
 
 
318 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.23 
 
 
254 aa  53.5  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  28.85 
 
 
248 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0187  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 
248 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.635564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 
248 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.04 
 
 
251 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  30 
 
 
203 aa  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  33.93 
 
 
272 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.28 
 
 
246 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.69 
 
 
249 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.17 
 
 
237 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.32 
 
 
251 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  27.86 
 
 
260 aa  51.2  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  41.89 
 
 
252 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.86 
 
 
256 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.62 
 
 
201 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.5 
 
 
203 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  31.4 
 
 
267 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.79 
 
 
268 aa  50.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  24.89 
 
 
252 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.65 
 
 
258 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  25.37 
 
 
255 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
249 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.56 
 
 
258 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.23 
 
 
255 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.33 
 
 
282 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
231 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.08 
 
 
273 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38170  predicted protein  33.88 
 
 
268 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0205  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.37 
 
 
251 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2301  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.28 
 
 
334 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2343  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.28 
 
 
334 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.88 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
387 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0798  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.03 
 
 
206 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.56 
 
 
258 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  31.2 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  30.08 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.56 
 
 
267 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.58 
 
 
255 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.45 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.45 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  39.68 
 
 
236 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.83 
 
 
576 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  38.94 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1858  molybdopterin biosynthesis MoeB protein, putative  35.78 
 
 
333 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.84 
 
 
239 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.43 
 
 
592 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00144  Thiamine biosynthesis protein ThiF  32.17 
 
 
233 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5151  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.59 
 
 
321 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  28.29 
 
 
272 aa  48.5  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35 
 
 
407 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.79 
 
 
207 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
586 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.24 
 
 
268 aa  48.5  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.9 
 
 
285 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 
253 aa  47.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  26.23 
 
 
251 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
456 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.11 
 
 
264 aa  47.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.79 
 
 
249 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  36 
 
 
253 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  35.9 
 
 
285 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.48 
 
 
199 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.16 
 
 
219 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.5 
 
 
283 aa  47.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.68 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 
264 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0677  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.66 
 
 
240 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.33 
 
 
270 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>