More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1916 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1916  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  100 
 
 
351 aa  703    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00387798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0018  hypothetical protein  35.43 
 
 
347 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.86 
 
 
354 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
355 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.58 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.97 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.49 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0766  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.69 
 
 
270 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0217212  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.51 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.79 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  27.41 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  24.8 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  23.92 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.86 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.73 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  22.86 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5151  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.82 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.49 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.46 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.11 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  31.91 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.23 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.42 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.1 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.19 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.79 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.29 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.78 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  20.31 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.72 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 
480 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.89 
 
 
278 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.38 
 
 
254 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.71 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.83 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.33 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.3 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853267  normal  0.0112488 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5019  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.505176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.54 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.2 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1910  MccB protein  29.2 
 
 
166 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00368063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  24.46 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.93 
 
 
266 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.26 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.99 
 
 
223 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.49 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  35.42 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  42.86 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.12 
 
 
253 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  27.45 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.04 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2024  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.09 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  22.59 
 
 
255 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  33.7 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.49 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2590  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
264 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.78 
 
 
200 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.28 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.85 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.14 
 
 
213 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2652  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.39 
 
 
249 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.08 
 
 
255 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 
244 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1233  molybdopterin biosynthesis protein  24.49 
 
 
269 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 
219 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.5 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.98 
 
 
258 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.14 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.41 
 
 
253 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.48 
 
 
237 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  25.18 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  36.46 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.27 
 
 
243 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.38 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.33 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.61 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  24.74 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  30.47 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4143  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.61 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.417024  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.69 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.63 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.49 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.96 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.71 
 
 
242 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.41 
 
 
476 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  23.39 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.82 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.82 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  23.65 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  31.96 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  36.59 
 
 
250 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>