77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5019 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5019  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 314 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.505176 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1916  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  23 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00387798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5151  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.45 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  24.45 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.28 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.75 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2652  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.1 
 
 		 373 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  29.41 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.53 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  30.4 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.72 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.17 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.15 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.58 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.27 
 
 		 199 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  30.4 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.31 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.67 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0694  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.27 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.06 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.14 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.24 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  37.08 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.11 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.61 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1742  hypothetical protein  31.48 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.56 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.26 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0489  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.09 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.93 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.67 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.9 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  35.48 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.47 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.07 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.6 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.37 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  36.07 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  30.83 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.11 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.96 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.07 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  36.67 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  42.31 
 
 		 203 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  26.92 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  36.07 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  38.33 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  31.97 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 		 243 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  34.25 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  29.06 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.77 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1430  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.33 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.83 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.75 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  32.95 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3417  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.19 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  37.5 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  31.86 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.09 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.17 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.1 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>