282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3931 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  98.28 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  96.9 
 
 		 290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  92.28 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  79.86 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  79.86 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  79.51 
 
 		 293 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  79.86 
 
 		 293 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  78.8 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  64.44 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  41.7 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  40.28 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  39.93 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  39.93 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  40.28 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  39.93 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  39.93 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  39.93 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  39.93 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  39.93 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  39.93 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  43.01 
 
 		 296 aa  228  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  38.73 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  38.73 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  38.38 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  40.64 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  38.38 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  38.38 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  38.38 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  37.46 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  38.03 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  38.87 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  36.13 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  36.65 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  36.4 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  33.82 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  33.81 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  34.64 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  33.81 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  35.34 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.23 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  33.57 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  33.89 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.54 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  29.12 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.52 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  32.47 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.14 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  30.63 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  29.67 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.75 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.72 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  29.82 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  30.37 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  28.86 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  28.72 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  28.38 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  28.38 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  28.38 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  31.19 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  28.04 
 
 		 357 aa  95.9  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  28.04 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  28.04 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  28.04 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  28.04 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  27.18 
 
 		 638 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  28.76 
 
 		 335 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  34.34 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  34.56 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  28.43 
 
 		 335 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  28.01 
 
 		 356 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  28.18 
 
 		 422 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  28.66 
 
 		 415 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  27.6 
 
 		 364 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  27.6 
 
 		 364 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  27.6 
 
 		 357 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  28.01 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  27.6 
 
 		 364 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  27.84 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  29.9 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.84 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  27.08 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.32 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  29.82 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  29.39 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  28.45 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  29.39 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  28.76 
 
 		 383 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  29.02 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  31.09 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.78 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  27.18 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  24.75 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  26.24 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  29.28 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  24.69 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  27.23 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  25 
 
 		 382 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.57 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.04 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>