More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3171 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3926  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.37 
 
 
263 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3859  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.22 
 
 
263 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0976  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.16 
 
 
271 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1079  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.12 
 
 
260 aa  410  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.23 
 
 
259 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.82 
 
 
259 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3658  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.82 
 
 
259 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3781  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.42 
 
 
259 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.92 
 
 
259 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0788  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.92 
 
 
258 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.24 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.43 
 
 
255 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0805  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.76 
 
 
283 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.2 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1084  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.5 
 
 
281 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06045  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.65 
 
 
277 aa  188  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.84 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.45 
 
 
271 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.55 
 
 
261 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.29 
 
 
265 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.69 
 
 
281 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.21 
 
 
262 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.66 
 
 
279 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.14 
 
 
291 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.52 
 
 
263 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.86 
 
 
289 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.46 
 
 
296 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.6 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.86 
 
 
261 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.92 
 
 
280 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.33 
 
 
248 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2041  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
319 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.833222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.14 
 
 
263 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.55 
 
 
276 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.38 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.38 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.88 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
271 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
286 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.61 
 
 
263 aa  149  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.32 
 
 
261 aa  148  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.66 
 
 
260 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.66 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.02 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.55 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1112  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.31 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000207078  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.32 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.38 
 
 
272 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.87 
 
 
298 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.81 
 
 
276 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.47 
 
 
296 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.15 
 
 
282 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.62 
 
 
274 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.52 
 
 
268 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
271 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.94 
 
 
288 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.16 
 
 
291 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.78 
 
 
268 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.9 
 
 
266 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.78 
 
 
268 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.25 
 
 
257 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.92 
 
 
269 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.7 
 
 
285 aa  142  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.21 
 
 
300 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.94 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.92 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.65 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.57 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.65 
 
 
283 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.19 
 
 
274 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.35 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.53 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.35 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.39 
 
 
273 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.47 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.78 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.76 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.36 
 
 
273 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.8 
 
 
256 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.99 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.4 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.71 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.4 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.68 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.26 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>