43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2355 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  526  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  41.88 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  37.24 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  36.68 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  33.07 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  32.16 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  31.84 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  31.43 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  30.68 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  33.2 
 
 		 234 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  33.2 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  34.02 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  31.74 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  27 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  32.93 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  27.47 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  28.03 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  29.93 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  23.75 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  27.16 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  25.11 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  25.55 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  24.67 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  24.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  24.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  24.67 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  24.56 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  22.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  26.94 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  25.45 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  22.66 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  23.32 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  24.9 
 
 		 226 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>