23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4432 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  97.44 
 
 		 937 aa  1876    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  98.09 
 
 		 942 aa  1893    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  89.22 
 
 		 937 aa  1725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  84.35 
 
 		 939 aa  1624    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  89.22 
 
 		 937 aa  1725    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  100 
 
 		 936 aa  1946    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  42.42 
 
 		 931 aa  592  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  27.19 
 
 		 935 aa  274  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  28.04 
 
 		 940 aa  269  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  27.73 
 
 		 1051 aa  261  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.67 
 
 		 960 aa  247  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  25.6 
 
 		 919 aa  210  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  24.89 
 
 		 900 aa  165  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1136 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  23.88 
 
 		 938 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  25.04 
 
 		 1313 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.85 
 
 		 1015 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  22.28 
 
 		 923 aa  99  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  21.7 
 
 		 923 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  21.89 
 
 		 924 aa  72  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  21.51 
 
 		 922 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1093 aa  50.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1172 aa  44.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>