46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2541 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2541    100 
 
 
387 bp  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    90.88 
 
 
1107 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  90.88 
 
 
978 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  90.62 
 
 
978 bp  462  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    91.81 
 
 
902 bp  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  87.19 
 
 
717 bp  347  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  89.55 
 
 
882 bp  309  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  85.07 
 
 
978 bp  299  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  83.61 
 
 
978 bp  167  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0548    82.88 
 
 
446 bp  151  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  93.2 
 
 
150 bp  149  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  79.93 
 
 
978 bp  119  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  80.07 
 
 
991 bp  115  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  81.87 
 
 
978 bp  99.6  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    81 
 
 
479 bp  95.6  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  81 
 
 
243 bp  95.6  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.85 
 
 
960 bp  91.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  85.85 
 
 
978 bp  91.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  80.83 
 
 
978 bp  89.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  87.64 
 
 
114 bp  89.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  86.81 
 
 
978 bp  85.7  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  87.06 
 
 
978 bp  81.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  89.71 
 
 
978 bp  79.8  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    83.93 
 
 
1007 bp  79.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  78.68 
 
 
978 bp  79.8  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  80.45 
 
 
978 bp  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  83.33 
 
 
951 bp  75.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  81.05 
 
 
978 bp  73.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  82.88 
 
 
981 bp  69.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    79.55 
 
 
1010 bp  63.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  81.98 
 
 
561 bp  61.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2257  hypothetical protein  86.57 
 
 
174 bp  61.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2259  hypothetical protein  83.53 
 
 
168 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  83.75 
 
 
978 bp  56  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  78.98 
 
 
624 bp  56  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  84.62 
 
 
978 bp  50.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  90 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  91.67 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  81.82 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  83.82 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  81.82 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  81.82 
 
 
978 bp  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    80.81 
 
 
210 bp  46.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  80.18 
 
 
978 bp  46.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  80.18 
 
 
978 bp  46.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  84.75 
 
 
978 bp  46.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>