21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0862 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  96.08 
 
 
153 aa  301  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  72.55 
 
 
153 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  72.55 
 
 
153 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  72.55 
 
 
153 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  71.14 
 
 
164 aa  207  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  75.18 
 
 
137 aa  191  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  52.59 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  46.71 
 
 
145 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  46.43 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  49.65 
 
 
145 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  45.07 
 
 
163 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  47.48 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  33.62 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  32.76 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4002  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.186831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>