155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  35.34 
 
 
284 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  30.26 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  37.67 
 
 
268 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  30.04 
 
 
270 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  37.93 
 
 
267 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  33.96 
 
 
263 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  31.96 
 
 
268 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  31.96 
 
 
268 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  33.96 
 
 
263 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 
268 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.89 
 
 
268 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.79 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  32 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  34.36 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  27.48 
 
 
262 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  41.18 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  31.97 
 
 
268 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  44.23 
 
 
350 aa  92.8  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  34.18 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.89 
 
 
267 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  33.08 
 
 
267 aa  92  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.96 
 
 
265 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  28.46 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.38 
 
 
266 aa  90.1  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  30 
 
 
438 aa  90.5  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  35.43 
 
 
265 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  27.23 
 
 
265 aa  88.6  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  32.48 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  27.64 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.56 
 
 
269 aa  85.9  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.59 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  33.09 
 
 
275 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
770 aa  85.1  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.09 
 
 
810 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  33.33 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  36.44 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  30.52 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  35.06 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.21 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  36.59 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  32.39 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  36.36 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  29.21 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  35.78 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  28.37 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  32.46 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  33.1 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  34.4 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.47 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  32.82 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.58 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  31.1 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  32.17 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  33.33 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  25.88 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  29.02 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  29.61 
 
 
291 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  27.97 
 
 
276 aa  62  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  29.87 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.23 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.15 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.79 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  27.7 
 
 
291 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27.7 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  36.21 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  30.71 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  24.84 
 
 
290 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  24.84 
 
 
290 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  25.87 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  28.76 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0652  cobalt transport protein  28.79 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  25.17 
 
 
285 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  29.41 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  32.23 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  29.08 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  29.03 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.05 
 
 
266 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  33.33 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  27.14 
 
 
308 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  26.2 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.97 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  30.56 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  30.84 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  26.03 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.38 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  35.71 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  32.58 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>