151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0005 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 83 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 81 bp  58  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 80 bp  54  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>